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案情：
金三系統(tǒng)上線后，稅務(wù)局通過比對查出了一部分納稅人取得增值稅專用發(fā)票并認(rèn)證抵扣之后，開票方將發(fā)票作廢，或者稅務(wù)機(jī)關(guān)通過實(shí)地調(diào)查、電話查詢、涉稅事項辦理核查以及其他征管手段，仍對企業(yè)和企業(yè)相關(guān)人員查無下落，將這些企業(yè)判定為走逃（失聯(lián)）企業(yè)。這些發(fā)票則被判定為為走逃（失聯(lián)）發(fā)票。根據(jù)稅法的相關(guān)規(guī)定，要求這些納稅人將抵扣的進(jìn)項稅額做了轉(zhuǎn)出，并補(bǔ)繳了增值稅。
解析：
《國家稅務(wù)總局關(guān)于走逃（失聯(lián)）企業(yè)開具增值稅專用發(fā)票認(rèn)定處理有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2016年第76號）第一條規(guī)定，走逃（失聯(lián)）企業(yè)的判定
走逃（失聯(lián)）企業(yè)，是指不履行稅收義務(wù)并脫離稅務(wù)機(jī)關(guān)監(jiān)管的企業(yè)。
根據(jù)稅務(wù)登記管理有關(guān)規(guī)定，稅務(wù)機(jī)關(guān)通過實(shí)地調(diào)查、電話查詢、涉稅事項辦理核查以及其他征管手段，仍對企業(yè)和企業(yè)相關(guān)人員查無下落的，或雖然可以聯(lián)系到企業(yè)代理記賬、報稅人員等，但其并不知情也不能聯(lián)系到企業(yè)實(shí)際控制人的，可以判定該企業(yè)為走逃（失聯(lián)）企業(yè)。
第二條規(guī)定，走逃（失聯(lián)）企業(yè)開具增值稅專用發(fā)票的處理
（一）走逃（失聯(lián)）企業(yè)存續(xù)經(jīng)營期間發(fā)生下列情形之一的，所對應(yīng)屬期開具的增值稅專用發(fā)票列入異常增值稅扣稅憑證（以下簡稱“異常憑證”）范圍。
1.商貿(mào)企業(yè)購進(jìn)、銷售貨物名稱嚴(yán)重背離的；生產(chǎn)企業(yè)無實(shí)際生產(chǎn)加工能力且無委托加工，或生產(chǎn)能耗與銷售情況嚴(yán)重不符，或購進(jìn)貨物并不能直接生產(chǎn)其銷售的貨物且無委托加工的。
2.直接走逃失蹤不納稅申報，或雖然申報但通過填列增值稅納稅申報表相關(guān)欄次，規(guī)避稅務(wù)機(jī)關(guān)審核比對，進(jìn)行虛假申報的。
（二）增值稅一般納稅人取得異常憑證，尚未申報抵扣或申報出口退稅的，暫不允許抵扣或辦理退稅；已經(jīng)申報抵扣的，一律先作進(jìn)項稅額轉(zhuǎn)出；已經(jīng)辦理出口退稅的，稅務(wù)機(jī)關(guān)可按照異常憑證所涉及的退稅額對該企業(yè)其他已審核通過的應(yīng)退稅款暫緩辦理出口退稅，無其他應(yīng)退稅款或應(yīng)退稅款小于涉及退稅額的，可由出口企業(yè)提供差額部分的擔(dān)保。經(jīng)核實(shí)，符合現(xiàn)行增值稅進(jìn)項稅額抵扣或出口退稅相關(guān)規(guī)定的，企業(yè)可繼續(xù)申報抵扣，或解除擔(dān)保并繼續(xù)辦理出口退稅。
分析上述規(guī)定，開票企業(yè)不履行稅收義務(wù)并脫離稅務(wù)機(jī)關(guān)監(jiān)管，稅務(wù)機(jī)關(guān)查無下落的企業(yè)稱之為走逃（失聯(lián)）企業(yè)。受票方取得的發(fā)票則成為走逃（失聯(lián)）發(fā)票。這些發(fā)票不得抵扣進(jìn)項稅額，也不得申請出口退稅。如果已經(jīng)抵扣或申請退稅的，要做轉(zhuǎn)出或者退稅部分提供擔(dān)保。
提示：
納稅人應(yīng)謹(jǐn)慎選擇供貨方，對其企業(yè)經(jīng)營情況、信用情況等進(jìn)行核實(shí)，認(rèn)證發(fā)票前要進(jìn)行發(fā)票的查詢，確定無異常情況再認(rèn)證抵扣，避免給企業(yè)帶來涉稅風(fēng)險。如果納稅人明知故犯，涉嫌虛開發(fā)票的，會涉及更嚴(yán)重的后果。